Samsun Çarşamba Havalimanıı İç Hatlar ve Dış hatlar terminali olarak tek bir terminal binası içerisinde hizmet vermektedir. Terminal binasının toplam alanı 11.500 metrekare olup 2138 metrekare iç hatlarlar gidiş arındırılmış salon 2587 metrekare dış hatlar gidiş arındırılmış salon olarak kullanılmaktadır. Havalimanı İç hatlar terminali yıllık 1.5 milyon dış hatlar terminali 500 bin yolcu kapasitesine sahiptir. Check-in işlemi iç ve dış hatlar için ortak kullanım alanında olan 18 tane check-in bankosu ile yürütülmektedir. Ayrıca Türk Hava Yolları (THY) ait 1 adet self check-in makinası vardır.